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2023-04-20 信息学院

百年校庆高端学术论坛-智能空间转录组学:为破译组织结构铺平道路

报告人:张世华

讲座时间:4月21日上午9:30

讲座地点: 信息学院2102智慧展厅

摘要:空间转录组学技术的重大进展使研究人员得以在全基因组层面测量组织切片中特定空间位点的基因表达信息。精确破译空间域是空间转录组数据解析中最基本和关键的环节。然而,现有方法并没有充分利用数据的空间位置信息,导致识别结果极易受到技术噪音的影响。我们针对不同空间转录组技术、不同生物组织建立了破译生物组织空间亚结构的人工智能算法与工具STAGATE。我们还进一步研究了空间变异基因识别、空间切片对齐等问题。这为解析空间数据提供了系列综合高效的工具,将对大规模空间转录组数据的精确解析提供助力。

 

个人简介:张世华,中国科学院数学与系统科学研究院研究员、中国科学院随材复杂结构与数据科学重点实验室副主任、中国科学院大学岗位教授。主要从事生物信息计算、机器智能与优化交叉研究。曾荣获中国青年科技奖、中科院卢嘉锡青年人才奖、教育部自然科学二等奖(排名第三) 、中创软人才奖、全国百篇优秀博士论文奖、中国科学院院长特别奖等。曾获得国家万人计划领军人才和青年拔尖、国家自然科学基金优青、中科院青年团队计划、中科院卓越青年科学家、中科院青年创新促进会等资助。成果分别入选2021年和2022年度中国生物信息学十大进展。